未来几年，重庆南山植物园的植物种类将逐步增加到万种以上，届时，只要在书中不是太生僻的植物在该园都可以找到，该园将被打造成“植物图书馆”。
　　由于南山山脉是该市主城区植物种类最多的地区，植物园因地制宜地建起植物标本馆，并引进全球100多种濒危植物，进行专门养护。在植物园的自然生态保护区中，还将建成地区性珍稀植物迁地保护中心、三峡库区特有及濒危植物区和引种驯化科研试验区。