此病在北方生产球茎地区主要是球腐烂；在南方冬季促成栽培区，往往在运往市场途中，如南方运往沈阳、大连、北京的唐菖蒲鲜切花时有危害，造成花腐。 病原菌是唐菖蒲球腐葡萄孢菌（BotrytisgladiolorumTimmermans），可为害植株的任何部位。罹病叶片上的病斑大小不匀，大老2厘米左右，或椭圆，呈褐色，较小的1厘米，在叶片正面上产生锈色斑点。在花梗上的斑点，开始时浅褐，以后转深。雨后高湿时，罹病花朵基部发生软腐，严重时花朵呈粘性腐烂状。 基腐或颈腐可在任何生长阶段发生，通常在天气潮湿的雨后雾露多时，剪花后发生，病菌沿主茎伤口向下蔓延至球茎髓部；球茎基部发病的多来自母球。 在天气转冷湿时（温度低于20℃），时逢花和球茎近成熟时则易流行。 防治措施：播种前将种球茎（去皮后）或子球，以52℃的多菌灵加百菌清500倍液，浸种30——40分钟；球茎收后在25——28℃条件下处理一周；田间植株发病，初期以500——800倍的乙烯菌核利喷洒防治。已发生病害的地块或保护地上所生产的花穗，在贮运、包装销售之前一定要以5000PPm的2—氨基丁烷碳酸盐快速浸泡，或用300PPm的多菌灵或乙烯菌核利处理也可以；如用百菌清或涕泌灵升华热粉尘处理，更安全有效，且不留痕迹。