在草花穴盘苗和成品花生产中，应保证植株能够持续获得一定水平的钙元素和镁元素，以及较高水平的硼元素。通常通过施肥解决这一问题，但是施肥之前必须对基地的水质和所用基质的特性作出全面的分析，然后根据植物种类、基质pH值选择正确的肥料种类。
　　施肥前要了解所用肥料中氮元素的形态，即氨态氮与硝态氮的比率。氨态氮可以转为硝态氮。硝态氮会提高基质的pH值，而氨态氮则会降低pH值，甚至尿素也会降低基质的pH值。一些杀菌剂（例如Subdue和Truban）会破坏基质中微生物，将氨态氮转化为硝态氮。若用这些杀菌剂进行灌溉时，应避免使用氨态氮含量高的肥料。
其次要了解肥料的性质，在施用前需要对肥料上的成分标签做仔细分析。专业的进口配方肥料上都会注明其潜性酸度或碱度，了解其含义，有助于我们在选择肥料时考虑不同配方对基质pH值的影响。潜性酸度(也叫当量酸度、生理酸度或残余酸度)，表示一定用量的肥料的酸性需要用多少碳酸钙来中和。例如：Plant-Prod肥料20-20-20的潜性酸度是每吨280千克碳酸钙，意思是施用一吨Plant-Prod肥料20-20-20的酸性需要用280千克的碳酸钙中和。潜性碱度(也叫当量的肥料碱度、生理碱度或残余碱度)，表示一定用量的肥料的碱性相当于添加了多少量的碳酸钙。例如，Plant-Prod肥料12-0-44的潜性碱度是每吨254公斤碳酸钙。这意味着施用一吨12-0-44的肥料碱性相当于往土壤中添加254公斤的碳酸钙。
　　最后应了解肥料中钙元素和镁元素的含量。例如15-0-15、14-0-14和13-2-13-6-3这三种肥料都是碱性肥料，会提高基质的pH值。若水中的钙和镁元素不足，就可以使用其中的一种肥料，尤其使最后一种，应为它里面的钙和镁元素含量比较高。
另外，环境因子也影响了我们所使用的肥料种类。例如，若光照较低，可以施用碱性肥料；若光照较强，则可以施用15-5-17或20-10-20等酸性肥料，后者可以使植株长得更快。若温度在15℃ 或16℃以下，不要施用含有铵根离子的肥料，因为在低温下不利于基质中微生物分解氨态氮，而且有可能引起植物中毒。
在植物的生长阶段，所施用肥料的种类会影响植物的营养生长和生殖生长的平衡。硝酸钾、15-5-17和14-0-14这三种肥料都可以促进植物开花，因为它们都含有较高的钾元素。而20-20-20和20-10-20由于其较高的磷元素和氨态氮/尿素的含量，则都可以促进植物的营养生长。
　　对于植物的根冠比来说，工厂化生产很看重根系的良好发育。如何获得良好的根系呢？当然其中的一个元素是水分，除此以外还有氮元素和钙元素，有时还与持续施加的磷（浓度20ppm）有关。虽然磷可以促进根系的发育，但是我们还是不要用量太多，氨态氮、尿素和磷可以促进植株上部的生长，但会使植株软弱无力而且根部不良。生产者不应该太多关注植株地上部分，因为我们可以很快改变它的长势。生产者应该关注的是根部的发展，即应该关注所用肥料中所含硝态氮、钙和硼的含量。
　　穴盘苗生产的基质中和草花生产中的上盘基质中最好不要添加缓释性肥料。因为随着平时灌溉所施用的14-14-14肥料已经可以提供足够的氮源。若生产时的温度在15℃左右，还有可能发生氨中毒的迹象；若生产温度在20℃左右，可以采用氨态氮和磷都比较低的肥料。在植物生长为成品苗后，也需要保证基质中含有一定的营养元素。