科学组配肥料，对改善肥料性能、充分发挥肥效有重要作用。
　　过磷酸钙与有机肥混合：过磷酸钙与有机肥料混合可以提高磷肥的肥效。因为有机肥能包围在过磷酸钙外面，减少磷与土壤的接触，防止土壤对磷的固定。同时有机肥分解产生的有机酸又能溶解难溶性磷，有利于植物的吸收和利用。二者混合堆沤，还可以减少有机肥中氮素的损失，起到以磷保氮的作用。
　　人粪尿中加过磷酸钙：人粪尿中若加入5%至10%的过磷酸钙，不仅可以减少人粪尿中氮的挥发，而且能补充磷素营养，二者相得益彰。
　　过磷酸钙与硫酸铵混合：过磷酸钙与硫酸铵混合会形成部分磷酸一铵和硫酸钙，既能同时供给作物氮、磷两种主要营养元素，又可以部分改善这两种肥料的理化性质。
　　过磷酸钙与磷矿粉混合：二者混合施用，过磷酸钙能保证作物前期对磷的需要，磷矿粉可满足作物旺盛生长期的需要，使作物的整个生育期都不至于缺磷。
　　有机肥料与氨水混沤：每100千克有机肥，加氨水3至4千克混合堆沤，既可以减少氨的挥发，又能调节有机肥的碳氮比例，从而加快堆肥的腐熟速度。
　　磷矿粉与硫酸铵混合：磷矿粉与硫酸铵混合施用，既能消除硫酸铵的生理酸性，又能增强磷矿粉的肥效，对作物生长发育大有好处。
　　但是，有些肥料不能混用。如碳酸氢铵与尿素不能混用，碳酸氢铵不可与菌肥混用，过磷酸钙不可与碱性肥料混用，碱性肥料不可与人粪尿混合。