⒈药害一般触杀性药剂（如乐果、敌敌畏、除草醚等）引起的药害，常表现为叶片呈烫伤状、水渍状，以后失水枯干，影响光合作用的正常进行。内吸性药剂主要表现为矮化，畸形叶，叶变厚而且色深绿，有的叶面皱缩等。严重时侧支丛生，生长点坏死。其药害显现症状的时间可以分为急性和慢性两种。急性药害在几小时或几天出现症状，如叶片出现条纹、斑点、变黄或变紫红、变形、卷缩、焦枯等。种子受害的发芽减少，多缺苗。慢性药害一般在施药后十余天或更长时间出现，表现生长缓慢，成熟期延长。除了一般杀虫剂和杀菌剂引起的药害外，一引起杀草剂和杀线虫剂（如二甲四氯、2，4-D，2，4-D丁酯）也有较强的生理活性作用，通常在低浓度时表现刺激作用，而高浓度时表现为抑制生长，导致畸形，甚至死亡。棉花对上述药物尤其敏感，受害后叶片变成细窄的“鸡爪状”，严重影响植株生长。其它如杀线虫剂、矮壮素等施用不当也易发生药害。
　　⒉环境污染
　　⑴大气污染：其污染源主要有SO₂,HCL，HS，各种粉尘和重金属等。棉花受到SO₂烟雾污染后，叶面布满黑色粉尘，叶色深绿变厚，植株变矮，严重时叶面出现枯斑。机车排放的NO₂经光化学反应而形成臭氧，其它排放物有硫和碳氢化合物及氮氧化合物等，它们经过氧化和光的作用，可以形成对植物有害的酸雨和过氧化乙烯硝酸盐，使叶片上出现白色或褐色“烟斑”。还有一些金属冶炼厂、磷肥厂、砖瓦厂和陶瓷厂等产生的粉尘，常使叶面覆盖而严重削弱光合作用。
　　⑵土壤污染：土壤污染主要来自化肥、农药、城市垃圾堆制的肥料和配合饲料、化肥厂的冶炼厂的排放物等。污染源主要是些重金属和类似金属的物质，例如硼、铜、铁、镁、镉、硅、汞、铅、砷、镍、钼、锌、硒、氟、碘等。其中有些是形成土壤的母岩中固有的，但含量极低，还有些是动植物所需的微量元素，由于人为污染，其含量已高达足以引致生物中毒的程度。在土中的重金属很难降解或排走，其对植物的危害因物种而异，一般以蔬菜等浅根植物最敏感，而棉花及禾谷作物较能忍耐。受害植株表现为根系发育受阻，地上叶色黄化或现紫斑、矮化和茎叶卷曲等，严重时全株死亡。金属污染物还可随食用部分进入食物链，危害人和动物。
　　⑶水域污染：其污染源与土壤类似，我国水系污染也日趋严重，1970年曾经发生过苏州河泥引起水稻苗大量死亡的事件，由于工厂排放的二苯醚所致。因工业污水排放入棉田，造成根系发育不良乃至部分棉株死亡。
　　防治依据及方法
　　非侵染性病害形成的原因十分复杂，其所表现的症状也有多种多样，而且有些不同因素引发的症状又有一定的程度雷同，给病害诊断增加了难度。在具体防治上应注意以下几点：
　　⑴根据棉花生长习性的特点，注意选地、茬口、耕作、水肥应用和管理。
　　⑵节制化学农药的应用，提高应用技术水平。
　　⑶提高识别和分析各类非侵染性病害的技能，及时准确诊断，以利采取挽救措施。例如灌水，施肥，中耕，以及一些营养元素的补充，可以缓解病情，减少损失。